Der 14-malige Olympiasieger gewann bei den amerikanischen Olympia-Ausscheidungen in Omaha/Nebraska das Finale über 200 Meter Lagen in der Weltjahresbestzeit von 1:54,84 Minuten knapp vor Weltmeister Ryan Lochte (1:54,93). Eine weitere Saisonbestmarke gelang Phelps anschließend mit 51,35 Sekunden im Halbfinale über 100 Meter Schmetterling.

Über die 200 Meter Brust schwamm Olympiasiegerin Rebecca Soni in diesem Jahr noch unerreichte 2:21,13 Minuten. Favorit Lochte sicherte sich den Titel über die 200 Meter Rücken in 1:54,54 Minuten. Jessica Hardy gewann die 100 Meter Freistil. Ihre Siegerzeit von 53,96 Sekunden liegt 31/100 Sekunden über der Saisonbestmarke der Berliner Olympiasiegerin Britta Steffen.