Eine katholische Schule in der New Yorker Bronx, 1964. Dort führt die gefürchtete prinzipientreue Schulleiterin Schwester Aloysius (Tabea Schiefer) mit eiserner Hand das Internat, wacht mit Argusaugen sowie Regeln, Strenge und Disziplin über die ihr anvertrauten Jungen. Der empathische und bei den Schülern beliebte Vater Flynn (Nicolas Funken) passt mit seinen fortschrittlichen Ansichten so gar nicht in ihr Weltbild.